借款发生的辅助费用核算操作，首先要弄清楚辅助费用的定义及其分类，其次，要明确辅助费用的发生时机，由此可确定相应的核算操作。
一般来讲，辅助费用是指与借款实际关联的各种费用，如担保费、管理费、咨询费、律师费等，它们是为了完成借款交易所付出的各种支出。每种辅助费用都有不同的发生时间，而且也有不同的支付者。
例如，担保费的发生时间是担保关系确定时，发生的担保费由借款方支付；咨询费的发生时间是借款协议签订时，咨询费用也由借款方支付；律师费的发生时间是借款文件完成时，律师费用也是由借款方支付的。根据辅助费用发生的时刻，确定辅助费用的支付者，就可以进行核算了。
借款发生的辅助费用核算操作，要求财务人员具备良好的财务知识和严格的核算流程，确保辅助费用及时发生，并能准确计算应付费用。
拓展知识：财务核算是企业管理的基础，根据企业实际情况采取不同的财务核算方法，可以使企业具有良好的竞争力。目前常见的财务核算方法有加权平均法、剩余价值法、直接成本法、反向折旧法等。